Los play off Europa league 2012-13 se sortearán el 10 de agosto y su partido de ida se disputará el 23 de agosto y el partido de vuelta el 30 de agosto del año 2012.Estos son los clubes clasificados para los pay off de la Europa league 2012-13:
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Newcastle United
Levante
Stuttgart
Lazio
Bordeaux
Sporting Lisboa
CSKA Moscu
Metalist Kharkiv
Dnipro
PSV Eindhoven
AZ Alkmaar
Trabzonspor
Atromitos
Midtjylland
Lokeren
Dinamo Bucarest
Hearts
Luzern
Hapoel Tel Aviv
Feyenoord
Debreceni VSC
F91 Dudelange
Slovan Liberec
FK Ekranas
Śląsk Wrocław
Sheriff Tiraspol
HJK Helsinki
Molde FK
PFC Neftchi Baku
Partizán Belgrado
| Ida | Vuelta | Total | |
| Liverpool-Hearts | 1-0 | 1-1 | 2-1 |
| Trabzonsport-videoton | 0-0 | ||
| Apoel – Neftchi | 1-1 | 1-3 | 2-4 |
| Az Alkmar-Anzhi | 1-0 | 0-5 | 1-5 |
| Motherwell-Levante | 0-2 | 0-1 | 0-3 |
| Molde FK – sc Heerenveen | 2-0 | 2-1 | 4-1 |
| Inter vs FC Vaslui | 2-0 | 2-2 | 4-2 |
| Feyenoord – Sparta Praga | 2-2 | 0-2 | 2-4 |
| FC Twente – Bursaspor | 1-3 | 3-1 | 4-4 |
| PSV-RK Zeta | 5-0 | 9-0 | 14-0 |
| Racing Genk – FC Luzern | 1-2 | 2-0 | 3-2 |
| AC Horsens-Sporting | 1-1 | 0-5 | 1-6 |
| Sheriff-Olympique Marsella | 1-2 | 0-0 | 1-2 |
| Lokeren-Viktoria Plzen | 2-1 | 0-1 | 2-2 |
| Athletic club-Hjk | 6-0 | 3-3 | 9-3 |
| F91 Dudelange-Hapoel Tel Aviv | 1-3 | 0-4 | 1-7 |
| Lazio-Mura 05 | 2-0 | 3-1 | 5-1 |
| Tromsø-Partizan | 3-2 | 0-1 | 3-3 |
| Slask Wroclaw-Hannover 96 | 3-5 | 1-5 | 4-10 |
| Legia Warszawa-Rosenborg | 1-1 | 1-2 | 2-3 |
| Debrecen-Club Brugge | 0-3 | 1-4 | 1-7 |
| Dinamo Bucuresti-Metalist | 0-2 | 1-2 | 1-4 |
| Crvena Zvezda-Bordeaux | 0-0 | 2-3 | 2-3 |
| Newcastle United-Atromitos | 1-1 | 1-0 | 2-1 |
| Young Boys-Midtjylland | 3-0 | 0-2 | 3-2 |
| Csk Moscu-AIK | 1-0 | 0-2 | 1-2 |
| Ekranas-Steaua Bucuresti | 0-2 | 0-3 | 0-5 |
| Dnipro Dnipropetrovsk-Slovan Liberec | 2-2 | 4-2 | 6-4 |
| Stuttgart-Dinamo Moscu | 2-0 | 1-1 | 3-1 |
| Rapid Viena-Paok | 1-2 | 3-0 | 4-2 |
De esta instancia se pasará a la fase de grupos; clasifican los que ganen los duelos respectivos.
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